2021年是实施“十四五”规划和全面建设特色鲜明的高水平医科大学新征程的开局之年。10月15日，学校下发《中共西南医科大学委员会 西南医科大学关于印发<西南医科大学事业发展“十四五” 规划和2035年远景目标>的通知》（西南医大委〔2021〕99 号），标志着学校总规编制全面完成，为学校高质量发展、内涵式建设提供了行动指南。“十四五”规划编制工作自2020年12月正式启动以来，学校坚定贯彻落实习近平总书记关于“规划科学是最大的效益”的重要论述，先后历经规划培训、调查研究、专题研讨、征求意见、法律审查等多个阶段，编制过程中得到了学校广大师生、海内外校友、离退休干部等各个层面的关心关注和大力支持。
规划明确，锚定到2035年基本建成特色鲜明的西部高水平医科大学的目标，“十四五”时期学校将以“136”发展战略和“双一流”为引领，实现学校博士学位授予单位及临床医学、中西医结合博士学位授权点“零”的突破，全面完成“总规”建设，加快推进治理体系和治理能力现代化，大力实施党建文化引领等6项重点工程，构建起“十四五”高质量指标体系近110项、重点任务11项，全面描绘了未来五年学校发展的蓝图。
同时，为全面促进规划落地落实、行稳致远，学校全面搭建统一规划体系的“四梁八柱”，构建了“1+11+20+X”（即1个总规引领下的11个专项规划+20个院系规划+若干个学科专业规划、部门规划）规划体系，规划权威性得到全面重塑，目标牵引性得到全面加强，学校事业发展的顶层设计和行动框架基本形成。
